A VOE legfőbb testületi szerve a Közgyűlés. A Közgyűlés évente legalább egy alkalommal ülésezik, összehívásáról az Elnökség gondoskodik. A Közgyűlés állapítja meg és módosítja az Alapszabályt, értékeli az Egyesület éves tevékenységét, határozza meg a következő év legfontosabb szakmai, érdekképviseleti feladatait és költségvetését.
A közgyűlések közötti időben az egyesület ügyvezető szerve az elnökség. Az elnökség 5 tagból – elnök, alelnökök, főtitkár – áll.